На кафедрі ґрунтознавства, яка у складі факультету розташовувалась у м. Харків, вул. Дзержинського (нині – Мироносицька), 92, почав формуватись кабінет мінералогії і петрографії. Зразки гірських порід і мінералів студенти і викладачі збирали у різних місцях м. Харкова і прилеглих областей під час навчальних практик з геології і ґрунтознавства. Багата колекція мінералів і гірських порід була розташована на цвинтарі по вул. Артема (нині – вул. Алчевських).
У 1977 р. за ініціативи зав. кафедри ґрунтознавства проф. О.М. Грінченка була закуплена колекція гірських порід і мінералів у м. Свердловську (нині – Єкатеринбург) на Уралі, де навчальні колекції виготовлялись у тресті «Русские самоцветы».
Навчальну колекцію гірських порід і мінералів відібрали і підготували для експозиції на кафедрі ґрунтознавства доц. Кірєєв О.О. і асистент (тепер професор) Тихоненко Д.Г.
У 1977 р. кафедра ґрунтознавства разом з агроуніверситетом перебазувались з м. Харкова на землі навчально-дослідного господарства «Докучаєвське» (тоді «Комуніст») у четвертий, новозбудований корпус, де розмістився факультет агрохімії і ґрунтознавства. Перебазуванням музею керувала доц. Чесняк О.А., яка в той час читала курс «Геологія з основами мінералогії».
Нині Музей геології і мінералогії розташований в ауд. 4-117 першого поверху території кафедри ґрунтознавства.
Досить різноманітна колекція мінералів і гірських порід музею умовно поділяється на п’ять складових частин:
- Колекція форм виділення представлена експонатами, які ілюструють типові форми знаходження мінералів у природі. У музеї нараховується 67 окремих зразків. Найбільшою окрасою цієї частини колекції є друзи піриту, кальциту, псевдоморфози по дереву, кістках; кристали кварцу.
- Колекція мінералів нараховує 340 експонатів, які розміщуються у шафах згідно їх хімічної класифікації. Найширше представлені силікати та алюмосилікати, які мають різний колір, зовнішні форми тощо.
- Колеція гірських порід нараховує 210 експонатів магматичних, метаморфічних і осадових порід.
- Колекція агрономічних руд включає зразки мінералів і гірських порід, які прямо чи опосередковано використовуються у сільському господарстві. Наприклад: фосфорити, апатити, селітри, гіпс, мергель, вапняки.
- Колекція зразків мінералів і порід, що були подаровані музею, зібрані окремо експонати, які студенти нашого агроуніверситету відібрали у польових умовах, під час експедиційних практик із ґрунтознавства, геології тощо.
У музеї є окремо відібрані колекції гірських порід і мінералів для самостійного вивчення студентами у позанавчальний час.
